El 24 de julio del año 2014, José Agüero fue encontrado muerto en su habitación de la vivienda de calle José Ingenieros al 1700 de Río Gallegos, en posición cubito dorsal, sobre el suelo y con lesiones punzo cortante, por policías de la Comisaría Cuarta, quienes acudieron al lugar, tras ser alertados por un amigo de Agüero, quien se acercó a la Comisaría y manifestó que hace varios días no tenía contacto con él y al dirigirse a su casa, no fue atendido y al regresar horas más tarde, advirtió que en la puerta había una boleta del canal, lo que llamó su atención ya que Agüero no suele dejar recibos.
Por su crimen fue detenido Emilio “Negro” Segura, sereno municipal, a quien en el expediente se lo acusa que entre los días 18 y 20 de julio del 2014, ingresó a la casa de Agüero, con el propósito de sustraerle la suma de $100.000, tras agredir a su víctima con el uso de un cuchillo y provocarle varias heridas punzo cortante en distintas partes del cuerpo. Dos de las lesiones tuvieron orificio de entrada en la pared antelo lateral del abdomen, heridas graves que le provocaron un shock hipovolemico.
Por este hecho Segura –representado- por el Dr. Víctor Robles, comenzó a ser juzgados por los jueces provinciales de esta capital, en la audiencia Segura decidió prestar declaración y negó haber asesinado a Segura, alegando que no tenía problemas económicos que lo pudieron llevar a sustraerle el dinero a Agüero. En este sentido además, manifestó que por “bueno” y llevarlo a comprar un televisor “termine metido en esta película”, así calificó la causa.